一文带你解读卷积神经网络自动判读胸部CT

译者:AlexanderZhao

本文介绍了利用机器学习实现胸部CT扫描图像自动判读的任务,这对我来说是一个有趣的课题,因为它是我博士论文研究的重点。这篇文章的主要参考资料是我最近的预印本“Machine-Learning-BasedMultipleAbnormalityPredictionwithLarge-ScaleChestComputedTomographyVolumes.”

CT扫描图像是一种大体积图像,大小约为××灰度像素,用于描绘心脏、肺和胸部的其他解剖结构。胸部CT扫描图像用于诊断和治疗多种疾病,包括癌症、感染和骨折。这篇文章讨论了如何获得CT图像,如何对CT图像进行判读,以及为什么CT图像的自动判读具有挑战性,最后,我们将介绍如何使用机器学习来实现CT图像的自动判读任务。

什么是CT扫描图像

胸部CT用于显示胸部,包括左肺、右肺、气道、心脏和大血管:

有关胸部解剖学的更详细概述,请参阅本文。

因为胸部CT扫描是一种三维图像,所以会在三个不同的解剖学平面上分辨观察,这三种解剖学平面分别是冠状面、横断面与矢状面。

i下面是一个横断面CT图像的例子:

下面是另一个横断面CT图像的例子:

想要了解同一张CT扫描图像在三个解剖学平面上的不同视图,请参阅本文,它含有一张可以滚动查看的健康人的高分辨率胸部CT图像。

CT图像是怎么获得的?

下图显示的是CT扫描仪,它是一个甜甜圈形状的仪器:

病人躺在桌子上,通过CT扫描仪的“甜甜圈孔”移动。以下是CT扫描仪的内部结构:

CT扫描是基于X射线的。然而,CT不同于“投影X射线”,因为CT是3D的,而投影X射线是2D的(关于自动投影X射线请参阅本文)。

CT扫描仪的X射线源将X射线束(如上图红色所示)通过患者的身体发送到探测器上。当患者通过中心孔时,整个放射源/探测器设备围绕患者旋转,因此可以在三维空间的多个点上测量患者身体的辐射密度。

最后,CT扫描图像使用Hounsfield单位对患者体内数百万个点的放射密度进行编码,其中空气显示为黑色,骨骼显示为白色。中等密度的组织呈灰色。

放射科医生如何判读CT扫描?

CT扫描是一种常见的影像学检查形式,对许多疾病的诊断和治疗非常有用。放射科医生是判读医学放射图像并撰写诊断报告的医生,这些报告供其他医生在患者的护理中使用。

当一个放射科医生需要判读一张CT扫描图像时,他会做两件事。首先,放射科医生必须确定出现了哪些异常,例如肺炎、肺不张、心脏肿大、结节、肿块、胸腔积液等。接下来,放射科医生必须在他们的描述中指定出现异常的位置。病灶位置在医学上往往非常重要——例如,不同类型的肺癌往往位于不同的位置。下表总结了放射科医生的任务:

CT报告示例

以下是美国国家诊断成像中心的胸部CT报告示例,其中文本是从本份公开报告中复制的:

EXAM:CTACHESTWW/OCONTRAST

CLINICALHISTORY:SOB,dyspnea,R/OPE,ILD,possibleoccupationallungdisease

INDICATIONS:49year-oldpatientwithshortnessofbreath.PossiblePE.Possibleoccupationallungdisease.

PROCEDURE:Consecutiveaxialsliceswereobtainedwithoutandwithintravenouscontrast.Bolusthinsliceswereperformedthroughthepulmonaryarteries.

Thepulmonarytrunkshowsnoevidenceforthrombusorembolus.Thereisnoevidenceforasaddleembolus.Therightandleftmainpulmonaryarteriesappearunremarkable.Thefirstandsecondorderpulmonarybranchesbilaterallydonotshowevidenceforembolus.Theaxillaryregionsshownoadenopathy.Themediastinumandhilarregionsshownomassesoradenopathy.Theincludedupperabdomenshowsspleniccalcificationwhichcouldindicateremotegranulomatousdisease.Thereissomefocalrenalcorticalthickeningontherightwheretheremaybepriorscarring.Thereisnoevidenceforpulmonaryparenchymalinterstitiallungdisease.Onimage2series4intheleftlowerlungthereisa3mmnodule.ThiscouldbefollowedwithsurveillanceCTin12monthsifthereisfurtherconcern.Thereisalsoasmallsimilarnoduleonthesameseriesimage49ontheleft.Therearenoinfiltratesoreffusions.Thereisnoacutebonyabnormalityseen.

IMPRESSION:Noevidenceforpulmonaryembolicdisease.Somesmalllungnodulesontheleftcouldbefollowedat12monthswithaCTifthereissufficientconcern.Noevidenceforinterstitiallungdisease.

为什么CT自动判读饶有趣味又充满挑战?

对于放射科医生来说,为每张CT扫描图像都撰写这么详细的报告是非常耗时的。如果患者接受了多次不同期的CT扫描(例如,首次扫描后的三个月又接受了后续的扫描),这就更加耗时了,因为在这种情况下,放射科医生还要同时比较两次扫描,以了解患者的健康状况产生了什么变化。人们对开发机器学习方法自动判读CT图像非常感兴趣,因为这可以加速放射工作流程并降低放射科医生的实时诊断错误率(目前为3-5%)。

CT扫描图像的自动判读具有挑战性,原因如下:

挑战1:患者的解剖结构根据性别、年龄、体重和正常的解剖变异而自然变化。因此,“变异”并不一定意味着“异常”。

挑战2:胸部CT图像可以显示数百种可能的异常。下图仅显示了几个例子,包括嗜酸性肺炎、空洞性病变、囊肿、肺气肿、气胸和肺纤维化:

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